De reden van het besluit van het Vaticaan is volgens betrouwbare Vaticaan-insiders de antivaccinatiehouding van Torres. Volgens berichten in de media had de autochtone Amerikaan gelovigen verdedigd die om gewetensredenen niet wilden voldoen aan de vaccinatie-eis in de coronapandemie. Hij weigerde ook een document van de Puerto Ricaanse bisschoppenconferentie te ondertekenen waarin stond dat niet-gevaccineerden niet mochten deelnemen aan kerkelijke activiteiten.
Bovendien wilde de bisschop in 2020 zijn kandidaten voor het priesterschap niet overdragen aan een nieuw interdiocesaan seminarie. De 57-jarige ging niet in op het verzoek om een gesprek in het Vaticaan. Volgens diverse media vond hij een reis vanwege de pandemie niet raadzaam. In december 2020 zorgde hij voor opschudding toen hij in een open brief de nieuwe gouverneur van Puerto Rico, Pedro Pierluisi, vroeg om het proces van gendermainstreaming te stoppen. Torres is sinds 2010 bisschop van Arecibo.